乐竞官网-乐竞(中国)一站式体育服务







欢(huān)迎(yíng)访问合肥乐竞官网和中科金臻生物医学(xué)有限公司官网! 加入收藏 |联系我们
乐竞官网-乐竞(中国)一站式体育服务
locations: 首页 - 新闻(wén)中心 - 公司新(xīn)闻(wén)

5hmC或(huò)成为2型糖尿病血管并发(fā)症临床监(jiān)控的重要标志(zhì)物

source:TIME:2019-10-01 08:00:00分享到(dào):

2019年(nián)10月1日,5-羟甲基化胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)在糖尿病研(yán)究领域取得重要进展。2型糖尿病(T2D)的血管并发症(zhèng)是(shì)导致2型糖尿病致残致死的重要病因,一(yī)直缺乏一种(zhǒng)无创便(biàn)捷的临床途径实现血管并发症(zhèng)的发生发展监测,达到早发现、早干预(yù),以提高T2D病人(rén)的整体(tǐ)生活质量,减(jiǎn)少(shǎo)卫生经(jīng)济负担。


该研(yán)究入组了62例(lì)2型(xíng)糖(táng)尿(niào)病病人,采用5hmC-Seal技术对(duì)血浆cfDNA中表(biǎo)观(guān)遗传标志物(wù)5hmC的分布情况进(jìn)行(háng)检(jiǎn)测,分析5hmC标志物与2型糖(táng)尿病血管并发(fā)症发(fā)生(shēng)发展的相关性(xìng)。结果表明5hmC标(biāo)志物的(de)变化与T2D合并大血管/微血管事件(jiàn)具有(yǒu)相关性,主要涉及一(yī)些与血管生(shēng)物(wù)学和(hé)糖尿病(包括胰岛素耐受和炎症反应)相关的基因和信号通路。该研究建立的16个(gè)基因-5hmC标志物组合(hé)检测可以准确区分有并发症和无并发(fā)症(zhèng)的2型糖尿病病(bìng)人[实验组(zǔ):AUC=0.85;95% CI,0.73-0.96],明显优于(yú)传统(tǒng)临床变量例如(rú)白蛋白尿。除此之外,还建(jiàn)立了13个基因-5hmC标志物组合检测,可以进一步区分(fèn)T2D合并(bìng)单一并发症和多种并发症[实验组:AUC=0.84;95% CI,0.68-0.99],同样明(míng)显优于其他传统临床变量。该研究得出(chū)结(jié)论(lùn),5hmC标志物(wù)反映了T2D病人大(dà)血(xuè)管/微血管并发症发生过程中的表(biǎo)观遗传变化,因而5hmC-Seal检测(cè)技术在监测糖尿病血管并发症发生和进展方面(miàn)具有良好的临床应用前景。


试验设计



本(běn)研究(jiū)共纳(nà)入62例2型糖尿病病人,包括没有(yǒu)血(xuè)管(guǎn)并发症的病人12例,有(yǒu)单(dān)一血管并发症的病(bìng)人(rén)34例(24例发生大(dà)血管事件,10例(lì)发生(shēng)微血管事(shì)件),以及有多种血管并(bìng)发症的病人16例(lì)。试验收(shōu)集(jí)62例病(bìng)人(rén)血浆,提取cfDNA,利(lì)用5hmC-Seal技术捕获外周血cfDNA中(zhōng)的(de)5hmC序列,进行二代测序(xù),通(tōng)过生物信息学分析找出并(bìng)发症(zhèng)组与(yǔ)无并发症(zhèng)组之间有显著5hmC修饰差异的基因(yīn),单一并发症组和多种并发(fā)症组之间有显著5hmC修饰差异的基因(yīn)。随后利用回归模型对差异基因(yīn)进一步筛选、优(yōu)化,弹(dàn)性(xìng)网络进一步筛(shāi)选,计算加(jiā)权平均分(fèn),最后得到一组具有高度灵敏度和特异(yì)性的5hmC生物(wù)标记物(wù),并进一(yī)步在实验组中验证,分(fèn)析其灵敏度和特异(yì)性(xìng)。并将新建立(lì)的5hmC标志物基(jī)因组合的检测性能(néng)与传统临床(chuáng)变量进行对比分析。最后对相关基因进行了信号通路分析(xī)和功能探究(jiū)。



研究结果(guǒ)


5hmC修饰水平(píng)与血(xuè)管并(bìng)发(fā)症具(jù)有相(xiàng)关性


利用逻辑回归模(mó)型(xíng)对62例有并发症和无并发症2型(xíng)糖尿(niào)病病人的(de)5hmC差(chà)异水(shuǐ)平进行分析发现(xiàn),有(yǒu)并发症2型(xíng)糖尿病(bìng)病人的622个(gè)差异修饰候选基因(包(bāo)括上调和下调基(jī)因(yīn))的归(guī)一化平均(jun1)数要明显高于无并(bìng)发症(zhèng)的(de)病(bìng)人(P<0.001),但(dàn)是单一并发症和多发并发症(zhèng)病(bìng)人之间没有显著(zhe)差(chà)异。

之后将有单一并发症或多种并发症(zhèng)的50例病人用逻辑回归模(mó)型进行了对比(bǐ),发现多(duō)种并发症(zhèng)的病人的153个差异(yì)修饰候选基因(包括上调和(hé)下调基因)的归一(yī)化平均数要低于无(wú)并(bìng)发症病人(P<0.001)。


5hmC标志物可(kě)区(qū)分有无并(bìng)发(fā)症患者


62例2型糖尿病病(bìng)人被随(suí)机分(fèn)成训练组(n=31)和测试组(zǔ)(n=31)。利用弹性网络筛选后发现,16基因-5hmC标志物组合检测可以用于区分有并发症(zhèng)和无并发(fā)症的2型糖尿病(bìng)病人。


基于(yú)16基因组(zǔ)合(hé)模型 (Detection Model 1) 的加权平(píng)均(jun1)分分析,发现(xiàn)无并发症(zhèng)病人的分数在训练集和测(cè)试集中都明(míng)显低于有(yǒu)并发症的病(bìng)人。只考虑加(jiā)权平均分(fèn)的话,受试者工(gōng)作特征(zhēng)曲线(ROC)分析表明将cutoff值设置成0.5时,在测试组(zǔ)中(zhōng)中的灵敏(mǐn)度(dù)为60%,特异性为(wéi)100%。



5hmC标志物可区分病人是单一并(bìng)发症(zhèng)还是(shì)多种并发症


50例(lì)有(yǒu)并(bìng)发(fā)症的2型糖尿病病(bìng)人被随机分成训练组(n=25)和测试(shì)组(zǔ)(n=25)。利(lì)用弹性网络筛选后发现,13基因(yīn)-5hmC标志物组合可以区分(fèn)2型糖(táng)尿病病人是否发生单(dān)一并(bìng)发症(zhèng)或(huò)多(duō)种(zhǒng)并发(fā)症(zhèng)。


基于13基因(yīn)组合模(mó)型(xíng) (Detection Model 2), 我们计算了单一并发症和(hé)多种并发症的加权(quán)平均分,发现在训(xùn)练集和(hé)测试集中单(dān)一并(bìng)发(fā)症(zhèng)和多种并发症病人的分数都(dōu)有明显差异。值(zhí)得一提(tí)的是,有肾病并发症和无肾(shèn)病并(bìng)发症病人的分数也有明显差异。利用(yòng)加权平均分作(zuò)为(wéi)判断标准的受试者(zhě)工(gōng)作特征曲线(ROC)表明(míng),在(zài)测试组(zǔ)中当将cutoff值设成0.69时,灵敏(mǐn)度(dù)为87.5%,特异性(xìng)为68.8%。



5hmC标志(zhì)物与传统临床变(biàn)量(liàng)/危险因子的对比


我们评估了(le)不(bú)同临床变量(liàng)/危险因子用于监(jiān)测(cè)血管并发症(zhèng)的灵敏度和特异性(xìng)(见表1)。

总(zǒng)体来(lái)说,结果表明一些临(lín)床(chuáng)变量(如尿液白蛋白、血清ALT、AST、肌酐(gān)、GGT、脂蛋白a)虽然具有一定的灵(líng)敏度和(hé)特异(yì)性,但(dàn)是整体准确度仍然差强人意,因此临(lín)床需要更加准确的(de)方法(fǎ)。另外,我们还在训(xùn)练(liàn)组中建立5hmC和(hé)不同临床变量的多变(biàn)量组合(hé)模(mó)型进行评估,该模型加(jiā)权平均分的AUC要明显大(dà)于传统临(lín)床变量(liàng)的AUC。若将(jiāng)这些临床(chuáng)变量与加权平均分(fèn)进行结(jié)合,AUC也将进一步提高。因此,该(gāi)多变量模型表明加权平均分可作为一个独立的指标(biāo)用于监测2型(xíng)糖尿病血管(guǎn)并发症(zhèng)。

信号通路分析和(hé)功能探究


有并(bìng)发(fā)症和无并发症病人的135个差(chà)异候选基因的功能注释(shì)分析表明,这些基因主要(yào)富(fù)集(jí)在一(yī)些经典的信号通路。错误发现率相关(guān)P值位于前10%和基(jī)因数目(mù)≥3的信号通路包括由(yóu)IGF1R, IL-10和FGFR2所介导的(de)信号通路。由IGF1R和IL-10介导的信号通路与胰岛素抵抗及(jí)炎症反应(yīng)相(xiàng)关,在血管生物学和糖(táng)尿病发生发展过程中发挥重要作用(yòng)。

Reactome相互作用网(wǎng)络的中心表明(míng),泛素编码基因[泛素B (UBB),泛素C (UBC),泛(fàn)素A-52亚基核糖(táng)体蛋白融合产物1(UBA52)]是候选基因(如SMAD3FOXD2DRAP1MCIDASMLNPIANPTBCC)的重要连接者。在这135个差异候选基因中(zhōng), 一些(xiē)基因 (如TNFRSF25P=0.027, HR=6.25; MLNP=0.0021, HR=20.40; CCL3L1P=0.018, HR=0.44)表现出(chū)与糖尿病病程相关的倾向,表明5hmC和糖尿病血管并发症之(zhī)间可(kě)能存(cún)在时间依赖性的相(xiàng)互作用。基(jī)于纵向时间队列的大(dà)样(yàng)本研究(jiū),将可(kě)进(jìn)一步明确5hmC变化和糖尿病持续(xù)时间之间的动态关联。关于单一并发(fā)症和多(duō)种并发症病人的159个候选标志基因的功(gōng)能注释研究发现,存在细胞-细胞连接(jiē)、胶原蛋(dàn)白形成、新陈(chén)代谢、细胞应激应答信号通路(lù)的富(fù)集,这(zhè)些(xiē)信号通路均与细胞(bāo)基本功能密切相关(guān)。


研(yán)究意(yì)义(yì)



血管并发症是(shì)三(sān)分之(zhī)二糖尿病病人的死亡原(yuán)因,若能及早有效控制血管并发症的(de)发(fā)生,将极大地改善(shàn)糖尿病病(bìng)人的生存质量。该研究建立了(le)一种利用cfDNA进行2型(xíng)糖尿病血(xuè)管(guǎn)并发症监测的无创便捷方法,较目前临床标(biāo)志物(wù)能更准确(què)地监控血管并发症的发生,从(cóng)而(ér)提示临床(chuáng)及(jí)早采(cǎi)取应(yīng)对措施,有效控制病(bìng)情进展。



合肥乐竞官网和中科金臻(zhēn)生物医学有限(xiàn)公司 版权所有 皖ICP备16021320号-1 Designed by Wanhu

乐竞官网-乐竞(中国)一站式体育服务

乐竞官网-乐竞(中国)一站式体育服务